Dans l'académie de Cross étudient deux classes différentes : la « Day Class », la classe de jour et la « Night Class », la classe de nuit. Les jeunes filles de la Day Class sont follement amoureuses des garçons de la Night Class, tous d'une beauté irrésistible. Mais elles ne les connaissent que très peu, car ces garçons sont des vampires.

La Night Class est un groupe de vampires nobles mené par leur chef Kaname, un sang-pur. La jeune Yuki et l’énigmatique Zero sont des chargés de discipline, qui ont pour mission d'assurer la paix entre vampires et humains de l'académie et ce dans le plus grand secret. Beaucoup de mystères entourent les vampires et leur camarade Zero, trop souvent distant. Quant à Yuki, c'est une jeune fille assez sentimentale, entretenant une très grande admiration et reconnaissance envers Kaname qui, il y a dix ans de cela, lui a sauvé la vie.

Zero est soupçonné à tort du meurtre de Shizuka Hiô, une vampire de sang pur, et condamné à mort par le Sénat, haut conseil des vampires. Mais Kaname intervient en sa faveur. Sauvé de justesse, Zero apprend que Shizuka n'était pas l'ennemie qu'il s'était imaginé, mais un pion contrôle par une autre éminence grise. De son côté Yûki, persuadée que sa mémoire effacée contient les clefs de la tragédie, s'efforce de retrouver des traces de son passé. Le voile s'apprête à se lever sur les mystères de chacun mais seront ils prêts à accepter l'horrible vérité ?

Yûma Tsukumo est un ado qui vit à Heartland City. Il adore se battre dans des duels même s’il perd toujours… il n’a pas beaucoup de talent mais c’est un combattant qui a de l’énergie à revendre et qui n’a peur de rien. Lorsqu’un nouveau défi se présente à lui, il fonce tête baissée, rarement pour le meilleur et souvent pour le pire.
Un jour, Shark, un voyou de son collège, le provoque en duel. Shark est déjà un duelliste de haut niveau qui a gagné de nombreux tournois. Le vainqueur du duel remportera toutes les cartes de son adversaire. Ce duel va-t-il mettre fin aux rêves de Yûma ?

Alors que Yûma est au bord de la défaite, une porte apparaît devant lui. Il avait déjà rêvé de cette porte de nombreuses fois.Une voix mystérieuse s’adresse à Yûma : « Un pouvoir illimité sera accordé à celui qui ouvrira cette porte, mais en échange ce dernier devra sacrifier une chose qui lui est chère. »

Yûma insère dans la serrure la « Clé des Rois » qu’il gardait toujours précieusement sur lui. Astral, un duelliste talentueux venu d’une autre dimension, vient en aide à Yûma qui gagne son duel.

Mais le prix de cette victoire est lourd… la mémoire d’Astral s’est dispersée aux quatre coins du monde sous la forme de 99 « Cartes Numbers ». Pour aider Astral à récupérer toutes les cartes, Yûma va devoir affronter de redoutables duellistes… sera-t-il assez talentueux pour mener à bien cette mission ?

Takuto Izumi est un jeune lycéen, tout ce qu'il y a de plus banal en apparence ; il adore le football qu'il pratique au club du lycée, et vit seul. Koji Nanjo, quant à lui, a arrêté le lycée pour commencer une carrière de chanteur.

Lors de son jogging quotidien, Izumi rencontre Koji, ivre mort, étalé à côté de poubelles. Il le ramène chez lui par pitié, et déclenche ainsi une longue et tortueuse histoire d'amour impossible.

Tout au long de ces cinq tomes, nous découvrons le lourd traumatisme qui a marqué l'enfance d'Izumi, et les sentiments désespérés de Koji se révélant homosexuel.